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Após a Reunião do Conselho Técnico, quando ficaram definidos os últimos detalhes da competição, a Federação Bahiana de Futebol (FBF) divulgou regulamento e tabela do Baianão Série B de 2016. A competição será disputada entre 10 de julho e 25 de setembro.
Nesta edição, seis clubes disputam uma única vaga na elite do estadual de 2017. Atlético de Alagoinhas, Atlântico, Associação Atlética Teixeira de Freitas, Catuense, Juazeiro e Ypiranga ficarão em um mesmo grupo, onde na fase de classificação se enfrentarão em jogos de ida e volta com pontos corridos.
O primeiro e segundo colocados do grupo avançam à final, onde também se enfrentarão e partidas de ida e volta. O campeão garantira o acesso à Série A.